MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori G27 chromosome

Total Repeats: 29602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011333	GAGC	2	8	18	25	25 %	0 %	50 %	25 %	208433977
2	NC_011333	TGA	3	9	111	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433977
3	NC_011333	TTCT	2	8	249	256	0 %	75 %	0 %	25 %	208433977
4	NC_011333	GTT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433977
5	NC_011333	T	7	7	308	314	0 %	100 %	0 %	0 %	208433977
6	NC_011333	T	7	7	336	342	0 %	100 %	0 %	0 %	208433977
7	NC_011333	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433977
8	NC_011333	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433977
9	NC_011333	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433978
10	NC_011333	TTA	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433978
11	NC_011333	C	6	6	632	637	0 %	0 %	0 %	100 %	208433978
12	NC_011333	CT	3	6	681	686	0 %	50 %	0 %	50 %	208433978
13	NC_011333	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433978
14	NC_011333	TCTG	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	208433978
15	NC_011333	TGA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433978
16	NC_011333	AAAT	2	8	902	909	75 %	25 %	0 %	0 %	208433979
17	NC_011333	CCG	4	12	1033	1044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433979
18	NC_011333	CCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433979
19	NC_011333	GCT	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
20	NC_011333	CA	3	6	1216	1221	50 %	0 %	0 %	50 %	208433979
21	NC_011333	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	208433979
22	NC_011333	GCT	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433979
23	NC_011333	TC	3	6	1275	1280	0 %	50 %	0 %	50 %	208433979
24	NC_011333	T	6	6	1337	1342	0 %	100 %	0 %	0 %	208433979
25	NC_011333	GGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433979
26	NC_011333	GCTT	2	8	1445	1452	0 %	50 %	25 %	25 %	208433979
27	NC_011333	TAAAA	2	10	1591	1600	80 %	20 %	0 %	0 %	208433979
28	NC_011333	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433979
29	NC_011333	GTTTT	2	10	1708	1717	0 %	80 %	20 %	0 %	208433980
30	NC_011333	TTC	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
31	NC_011333	A	7	7	1767	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	208433980
32	NC_011333	ATTATA	2	12	1785	1796	50 %	50 %	0 %	0 %	208433980
33	NC_011333	CCTG	2	8	1800	1807	0 %	25 %	25 %	50 %	208433980
34	NC_011333	CCAA	2	8	1824	1831	50 %	0 %	0 %	50 %	208433980
35	NC_011333	TGAA	2	8	1864	1871	50 %	25 %	25 %	0 %	208433980
36	NC_011333	GTT	2	6	1887	1892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433980
37	NC_011333	GC	3	6	1902	1907	0 %	0 %	50 %	50 %	208433980
38	NC_011333	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	208433980
39	NC_011333	TTC	2	6	1974	1979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433980
40	NC_011333	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433980
41	NC_011333	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433980
42	NC_011333	AATG	2	8	2054	2061	50 %	25 %	25 %	0 %	208433980
43	NC_011333	G	6	6	2179	2184	0 %	0 %	100 %	0 %	208433980
44	NC_011333	A	8	8	2531	2538	100 %	0 %	0 %	0 %	208433981
45	NC_011333	TCTT	2	8	2547	2554	0 %	75 %	0 %	25 %	208433981
46	NC_011333	T	7	7	2627	2633	0 %	100 %	0 %	0 %	208433981
47	NC_011333	TGA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433981
48	NC_011333	T	7	7	2669	2675	0 %	100 %	0 %	0 %	208433981
49	NC_011333	GC	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	208433981
50	NC_011333	A	6	6	2818	2823	100 %	0 %	0 %	0 %	208433981
51	NC_011333	GTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
52	NC_011333	AGA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	208433981
53	NC_011333	GTG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433981
54	NC_011333	GCC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433981
55	NC_011333	GAAA	2	8	3237	3244	75 %	0 %	25 %	0 %	208433982
56	NC_011333	TG	3	6	3419	3424	0 %	50 %	50 %	0 %	208433982
57	NC_011333	GCG	2	6	3541	3546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
58	NC_011333	GGT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433982
59	NC_011333	CTA	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433982
60	NC_011333	AGAA	2	8	3768	3775	75 %	0 %	25 %	0 %	208433982
61	NC_011333	A	6	6	3856	3861	100 %	0 %	0 %	0 %	208433982
62	NC_011333	ATT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433982
63	NC_011333	GGC	2	6	3969	3974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	208433982
64	NC_011333	T	8	8	4606	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	208433983
65	NC_011333	AAT	2	6	4627	4632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433983
66	NC_011333	A	7	7	4696	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	208433983
67	NC_011333	TAG	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
68	NC_011333	TCGC	2	8	5176	5183	0 %	25 %	25 %	50 %	208433984
69	NC_011333	CATT	2	8	5249	5256	25 %	50 %	0 %	25 %	208433984
70	NC_011333	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
71	NC_011333	C	6	6	5334	5339	0 %	0 %	0 %	100 %	208433984
72	NC_011333	TGG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
73	NC_011333	A	6	6	5481	5486	100 %	0 %	0 %	0 %	208433984
74	NC_011333	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
75	NC_011333	T	6	6	5513	5518	0 %	100 %	0 %	0 %	208433984
76	NC_011333	TTG	2	6	5572	5577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
77	NC_011333	TAA	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433984
78	NC_011333	TTA	2	6	5698	5703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
79	NC_011333	GTG	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433984
80	NC_011333	GC	3	6	5829	5834	0 %	0 %	50 %	50 %	208433984
81	NC_011333	CAA	2	6	5835	5840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	208433984
82	NC_011333	T	6	6	6036	6041	0 %	100 %	0 %	0 %	208433984
83	NC_011333	CAG	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433984
84	NC_011333	AC	3	6	6255	6260	50 %	0 %	0 %	50 %	208433984
85	NC_011333	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433984
86	NC_011333	TAG	7	21	6389	6409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433984
87	NC_011333	TTA	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	208433984
88	NC_011333	CGT	2	6	6438	6443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
89	NC_011333	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
90	NC_011333	GTT	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
91	NC_011333	T	6	6	6755	6760	0 %	100 %	0 %	0 %	208433984
92	NC_011333	ATCG	2	8	6795	6802	25 %	25 %	25 %	25 %	208433984
93	NC_011333	GCT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	208433984
94	NC_011333	CGTT	2	8	6830	6837	0 %	50 %	25 %	25 %	208433984
95	NC_011333	GTT	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	208433984
96	NC_011333	T	6	6	6903	6908	0 %	100 %	0 %	0 %	208433984
97	NC_011333	A	6	6	6969	6974	100 %	0 %	0 %	0 %	208433984
98	NC_011333	GA	7	14	7008	7021	50 %	0 %	50 %	0 %	208433984
99	NC_011333	T	7	7	7031	7037	0 %	100 %	0 %	0 %	208433984
100	NC_011333	CAT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
101	NC_011333	GCC	2	6	7383	7388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
102	NC_011333	TCT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
103	NC_011333	GAAACC	2	12	7492	7503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	208433985
104	NC_011333	AAT	2	6	7542	7547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	208433985
105	NC_011333	CTT	2	6	7550	7555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
106	NC_011333	TTCA	2	8	7620	7627	25 %	50 %	0 %	25 %	208433985
107	NC_011333	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
108	NC_011333	GC	3	6	7687	7692	0 %	0 %	50 %	50 %	208433985
109	NC_011333	ATG	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
110	NC_011333	TCA	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
111	NC_011333	CG	3	6	7752	7757	0 %	0 %	50 %	50 %	208433985
112	NC_011333	CCG	2	6	7771	7776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
113	NC_011333	CTT	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
114	NC_011333	CCG	2	6	7799	7804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
115	NC_011333	T	6	6	7839	7844	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
116	NC_011333	AG	3	6	7899	7904	50 %	0 %	50 %	0 %	208433985
117	NC_011333	CAT	2	6	7994	7999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
118	NC_011333	GTG	2	6	8026	8031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	208433985
119	NC_011333	TTC	2	6	8106	8111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
120	NC_011333	CCG	2	6	8125	8130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	208433985
121	NC_011333	TTTCT	2	10	8156	8165	0 %	80 %	0 %	20 %	208433985
122	NC_011333	CAC	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	208433985
123	NC_011333	GAT	2	6	8268	8273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
124	NC_011333	T	6	6	8300	8305	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
125	NC_011333	GGA	2	6	8315	8320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	208433985
126	NC_011333	T	7	7	8339	8345	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
127	NC_011333	CGTT	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	208433985
128	NC_011333	GA	3	6	8416	8421	50 %	0 %	50 %	0 %	208433985
129	NC_011333	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
130	NC_011333	T	6	6	8607	8612	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
131	NC_011333	T	6	6	8619	8624	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
132	NC_011333	TGA	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	208433985
133	NC_011333	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433985
134	NC_011333	GCA	2	6	8764	8769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	208433985
135	NC_011333	T	6	6	8891	8896	0 %	100 %	0 %	0 %	208433985
136	NC_011333	CAT	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	208433985
137	NC_011333	T	6	6	9048	9053	0 %	100 %	0 %	0 %	208433986
138	NC_011333	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	208433986
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